水牛研究所的工作及其在水牛产业化开发中的重要作用越来越突显出来。1994年，水牛种畜场被农业部评为全国重点种畜场；1999年，国家外国专家局授予广西首批“乳肉兼用水牛的引进与开发利用”引智成果推广示范基地，2004年期满后继续授予“乳肉兼用水牛的繁育推广与开发利用”引智成果推广示范基地；2001年和2004年，中国农学会分别授予“全国农业科普示范基地”和“全国农业科普先进集体”；2002年和2005年，遗传繁殖研究室被广西区科技厅分别评为首批“广西科技创新金源单位”和“广西水牛繁殖工程技术研究中心”；2004年，广西区人事厅授予广西首批人才小高地——“广西水牛研发人才小高地”。水牛研究所已成为全国最大的良种水牛繁育中心和技术培训基地。